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Un logiciel pour calculer l’ascendance génétique

Un groupe de scientifiques, mathématiciens et biologistes du monde entier ont développé un algorithme permettant de calculer l’ascendance génétique de plusieurs milliers d’individus en quelques minutes. Les résultats de ces travaux seront publiées en Septembre 2007 dans le journal PLoS Genetics.

Contrairement aux programmes précédents qui requièrent une connaissance préalable d’au moins une ascendance individuelle, ce nouvel algorithme étudie les marqueurs ADN appelés “single nucleotide polymorphisms”, ou SNP, et ne nécessite rien d’autre qu’un échantillon d’ADN sous forme de prélévement buccal. Les chercheurs ont utilisé des données génétiques issues de précédentes études pour réaliser et confirmer leurs recherches, y compris la nouvelle base de données HapMap utilisée pour les recherches sur le génome humain.

“Maintenant que nous avons prouvé que le programme fonctionne parfaitement, nous espérons l’implémenter largement et faire des recherches sur des milliers de SNP et d’individus” déclare Petros Drineas, auteur principal de l’étude et professeur assistant en science informatique au Rensselaer Polytechnic Institute. “Le programme sera un excellent outil pour comprendre nos ascendances génétiques et trouver des nouveaux médicaments et traitements médicaux.”

Les chercheurs impliqués dans ces travaux sont Petros Drineas ; Peristera Paschou de la Democritus University of Thrace en Grèce ; Elad Ziv, Esteban G. Burchard, et Shweta Choudhry de l’University of California, San Francisco ; William Rodriguez-Cintron de l’University of Puerto Rico School of Medicine à San Juan ; et Michael W. Mahoney de Yahoo! Research en California.

in Rensselaer Polytechnic Institute
Traduction : Jean-Yves Baxter

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